银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证

苏西娅1, 石元豹1, 杨晓明1, 汪贵斌1,2, 曹福亮1,2,*
1南京林业大学, 南方现代林业协同创新中心, 南京210037; 2江苏省农业种质资源保护与利用平台, 南京210014

通信作者:曹福亮;E-mail: fuliangcaonjfu@163.com

摘 要:

为了筛选出银杏中稳定的内参基因用于实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析, 本研究以银杏(Ginkgo biloba)的不同组织, 不同发育时期雌株、雄株叶片为材料, 使用3种软件geNorm, NormFinderand和Bestkeeper综合评估银杏中常见的7个内参基因(GbACTGbUBQ GbEF-1α1GbEF-1α2GbGAPDHGb18SGb26S)的稳定性, 并用查尔酮合酶基因(Chalcone synthase, CHS)对内参基因稳定性进行验证。结果表明, 候选基因的稳定性各异, GbUBQ是所有测试样品和不同发育时期雄株叶片中表达最稳定的基因, GbACT是不同时期雌株叶片表达最稳定的内参基因, GbGAPDH是不同组织中表达最稳定的基因。

关键词:银杏; 内参基因; 实时荧光定量PCR; 验证

收稿:2018-11-27   修定:2019-05-09

资助:国家重点研发计划课题(2017YFD0600701)和江苏省高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)

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